Paket: snpomatic (1.0-7 och andra)

[ Källkod: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej arm64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, riscv64]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta snpomatic

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.0-7	83,6 kbyte	208,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.0-7+b1	72,4 kbyte	217,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.0-7	66,4 kbyte	167,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.0-7	67,5 kbyte	127,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.0-7	85,9 kbyte	211,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.0-7	74,8 kbyte	222,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.0-7	82,2 kbyte	216,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.0-7	77,9 kbyte	156,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.0-7	79,3 kbyte	204,0 kbyte	[filförteckning]