Pakiet: snpomatic (1.0-7 i inne)

[ Pakiet źródłowy: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Narzędzie, Przeznaczenie: use::comparing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, arm64, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie ia64]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie snpomatic

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0-7	76,0 KiB	217,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0-7	83,6 KiB	208,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0-7+b1	72,4 KiB	217,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0-7	66,4 KiB	167,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0-7	67,5 KiB	127,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0-7	76,0 KiB	180,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0-7	85,9 KiB	211,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0-5	106,7 KiB	393,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0-7	73,6 KiB	183,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0-7	74,8 KiB	222,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0-7	80,1 KiB	280,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0-7	82,2 KiB	216,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0-7	77,9 KiB	156,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0-7	79,3 KiB	204,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0-7	90,2 KiB	215,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0-7	67,5 KiB	1 050,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0-7	83,3 KiB	199,0 KiB	[lista plików]