Paket: snpomatic (1.0-6)

[ Källkod: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Märken: Field: Biologi, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Andra paket besläktade med snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta snpomatic

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	83,1 kbyte	216,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	74,2 kbyte	216,0 kbyte	[filförteckning]
armel	67,5 kbyte	175,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	69,4 kbyte	135,0 kbyte	[filförteckning]
i386	85,7 kbyte	219,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	77,2 kbyte	286,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	77,6 kbyte	284,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	86,0 kbyte	280,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	73,6 kbyte	212,0 kbyte	[filförteckning]