Пакет: snpomatic (1.0-7 и другие)

[ Источник: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Теги: Область: Биология, Биоинформатика, Реализовано на: implemented-in::c, interface::commandline, Роль: Программа, Область: Утилита, Цель: use::comparing, works-with::biological-sequence

Другие пакеты, относящиеся к snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, arm64, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не ia64]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

Загрузка snpomatic

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.0-7	76,0 Кб	217,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.0-7	83,6 Кб	208,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.0-7+b1	72,4 Кб	217,0 Кб	[список файлов]
armel	1.0-7	66,4 Кб	167,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.0-7	67,5 Кб	127,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.0-7	76,0 Кб	180,0 Кб	[список файлов]
i386	1.0-7	85,9 Кб	211,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.0-5	106,7 Кб	393,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.0-7	73,6 Кб	183,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.0-7	74,8 Кб	222,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.0-7	80,1 Кб	280,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.0-7	82,2 Кб	216,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.0-7	77,9 Кб	156,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.0-7	79,3 Кб	204,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.0-7	90,2 Кб	215,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.0-7	67,5 Кб	1 050,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.0-7	83,3 Кб	199,0 Кб	[список файлов]