软件包：snpomatic（1.0-7 以及其他的）

[ 源代码： snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

标签: 领域: 生物学, 生物信息学, 实做语言: implemented-in::c, interface::commandline, 角色: 程序, 范围: 实用程序, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

其他与 snpomatic 有关的软件包

• dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, arm64, ia64, loong64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 ia64]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

下载 snpomatic

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	1.0-7	76.0 kB	217.0 kB	[文件列表]
amd64	1.0-7	83.6 kB	208.0 kB	[文件列表]
arm64	1.0-7+b1	72.4 kB	217.0 kB	[文件列表]
armel	1.0-7	66.4 kB	167.0 kB	[文件列表]
armhf	1.0-7	67.5 kB	127.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	1.0-7	76.0 kB	180.0 kB	[文件列表]
i386	1.0-7	85.9 kB	211.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	1.0-5	106.7 kB	393.0 kB	[文件列表]
loong64 （非官方移植版）	1.0-7	71.7 kB	185.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	1.0-7	73.6 kB	183.0 kB	[文件列表]
mips64el	1.0-7	74.8 kB	222.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.0-7	80.1 kB	280.0 kB	[文件列表]
ppc64el	1.0-7	82.2 kB	216.0 kB	[文件列表]
riscv64	1.0-7	77.9 kB	156.0 kB	[文件列表]
s390x	1.0-7	79.3 kB	204.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	1.0-7	90.2 kB	215.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.0-7	67.5 kB	1,050.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	1.0-7	83.3 kB	199.0 kB	[文件列表]