Package: snpomatic (1.0-7 and others)

[ Source: snpomatic  ]

software per mappatura di letture corte veloce e stringente

Le tecnologie di sequenziamento ad alte prestazioni generano grandi quantità di letture corte. La mappatura di queste ultime in una sequenza di riferimento consuma grandi quantità di tempo di elaborazione e memoria, e gli errori di mappatura delle letture possono portare a allineamenti con rumore o non corretti.

SNP-o-matic è un software per mappatura di letture corte veloce e stringente. Gestisce una moltitudine di tipi e formati di output, per l'utilizzo nel filtraggio di letture, allineamenti, identificazione di genotipi sulla base di sequenze, riassemblaggio assistito di contigui, ecc.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, arm64, ia64, sh4]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [not ia64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

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Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.0-7	76.0 kB	217.0 kB	[list of files]
amd64	1.0-7	83.6 kB	208.0 kB	[list of files]
arm64	1.0-7+b1	72.4 kB	217.0 kB	[list of files]
armel	1.0-7	66.4 kB	167.0 kB	[list of files]
armhf	1.0-7	67.5 kB	127.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.0-7	76.0 kB	180.0 kB	[list of files]
i386	1.0-7	85.9 kB	211.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.0-5	106.7 kB	393.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.0-7	73.6 kB	183.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0-7	74.8 kB	222.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.0-7	80.1 kB	280.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0-7	82.2 kB	216.0 kB	[list of files]
riscv64	1.0-7	77.9 kB	156.0 kB	[list of files]
s390x	1.0-7	79.3 kB	204.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.0-7	90.2 kB	215.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.0-7	67.5 kB	1,050.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.0-7	83.3 kB	199.0 kB	[list of files]