Paket: snpomatic (1.0-7 und andere)

[ Quellcode: snpomatic  ]

fast, stringent short-read mapping software

High throughput sequencing technologies generate large amounts of short reads. Mapping these to a reference sequence consumes large amounts of processing time and memory, and read mapping errors can lead to noisy or incorrect alignments.

SNP-o-matic is a fast, stringent short-read mapping software. It supports a multitude of output types and formats, for uses in filtering reads, alignments, sequence-based genotyping calls, assisted reassembly of contigs etc.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::comparing, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, arm64, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht ia64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

snpomatic herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.0-7	76,0 kB	217,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.0-7	83,6 kB	208,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.0-7+b1	72,4 kB	217,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.0-7	66,4 kB	167,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.0-7	67,5 kB	127,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.0-7	76,0 kB	180,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.0-7	85,9 kB	211,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.0-5	106,7 kB	393,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.0-7	73,6 kB	183,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.0-7	74,8 kB	222,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.0-7	80,1 kB	280,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.0-7	82,2 kB	216,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.0-7	77,9 kB	156,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.0-7	79,3 kB	204,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.0-7	90,2 kB	215,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.0-7	67,5 kB	1.050,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.0-7	83,3 kB	199,0 kB	[Liste der Dateien]