Pakiet: python3-cyvcf2 (0.30.4-4)

[ Pakiet źródłowy: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Inne pakiety związane z python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nie amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

• dep: python3-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

Pobieranie python3-cyvcf2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	787,7 KiB	4 755,0 KiB	[lista plików]
arm64	758,6 KiB	4 694,0 KiB	[lista plików]
armel	758,7 KiB	4 662,0 KiB	[lista plików]
armhf	759,8 KiB	4 482,0 KiB	[lista plików]
i386	787,5 KiB	4 779,0 KiB	[lista plików]
mips64el	742,9 KiB	4 773,0 KiB	[lista plików]
mipsel	743,9 KiB	4 724,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	787,2 KiB	4 870,0 KiB	[lista plików]
s390x	751,4 KiB	4 749,0 KiB	[lista plików]