Pakiet: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3 i inne)

[ Pakiet źródłowy: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Inne pakiety związane z sprai

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: time

  Program GNU time do pomiaru wykorzystania zasobów procesora

• sug: make

  Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji

• sug: pbalign

  Pakiet niedostępny

• sug: pbgenomicconsensus

  Pakiet niedostępny

• sug: pbh5tools

  Pakiet niedostępny

Pobieranie sprai

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 476,5 KiB	1 881,0 KiB	[lista plików]
amd64	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,2 KiB	1 713,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.9.9.23+dfsg1-3	1 473,8 KiB	1 881,0 KiB	[lista plików]
armel	0.9.9.23+dfsg1-3	1 473,0 KiB	1 693,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.9.9.23+dfsg1-3	1 471,6 KiB	1 669,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 475,5 KiB	1 692,0 KiB	[lista plików]
i386	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,6 KiB	1 713,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 485,0 KiB	1 738,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 474,6 KiB	1 693,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,2 KiB	1 885,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,7 KiB	1 881,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1 478,1 KiB	1 881,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.9.9.23+dfsg1-3	1 474,3 KiB	1 689,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.9.9.23+dfsg1-3	1 476,0 KiB	1 701,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,7 KiB	1 877,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 474,5 KiB	5 722,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 476,4 KiB	1 705,0 KiB	[lista plików]