Pakiet: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3)

[ Pakiet źródłowy: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Inne pakiety związane z sprai

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: time

  Program GNU time do pomiaru wykorzystania zasobów procesora

• sug: make

  Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji

• sug: pbalign

  Pakiet niedostępny

• sug: pbgenomicconsensus

  Pakiet niedostępny

• sug: pbh5tools

  Pakiet niedostępny

Pobieranie sprai

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1 477,2 KiB	1 713,0 KiB	[lista plików]
arm64	1 473,8 KiB	1 881,0 KiB	[lista plików]
armel	1 473,0 KiB	1 693,0 KiB	[lista plików]
armhf	1 471,6 KiB	1 669,0 KiB	[lista plików]
i386	1 477,6 KiB	1 713,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1 477,2 KiB	1 885,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1 478,1 KiB	1 881,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1 474,3 KiB	1 689,0 KiB	[lista plików]
s390x	1 476,0 KiB	1 701,0 KiB	[lista plików]