Pacote: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3 e outros)

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Pacotes similares:

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Outros pacotes relacionados a sprai

depende

recomenda

sugere

melhora

dep: libc6 (>= 2.34) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
dep: ncbi-blast+

next generation suite of BLAST sequence search tools
dep: perl

Linguagem de extração e relatórios prática de Larry Wall
dep: time

programa "time" do GNU para medição do uso de recursos da CPU

sug: make

utilitário para compilação direta
sug: pbalign

Pacote não disponível
sug: pbgenomicconsensus

Pacote não disponível
sug: pbh5tools

Pacote não disponível

Download de sprai

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis
Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,476.5 kB	1,881.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.2 kB	1,713.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	0.9.9.23+dfsg1-3	1,473.8 kB	1,881.0 kB	[lista de arquivos]
armel	0.9.9.23+dfsg1-3	1,473.0 kB	1,693.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	0.9.9.23+dfsg1-3	1,471.6 kB	1,669.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,475.5 kB	1,692.0 kB	[lista de arquivos]
i386	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.6 kB	1,713.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	0.9.9.23+dfsg1-2	1,485.0 kB	1,738.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,475.8 kB	1,721.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,474.6 kB	1,693.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.2 kB	1,885.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.7 kB	1,881.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1,478.1 kB	1,881.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	0.9.9.23+dfsg1-3	1,474.3 kB	1,689.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	0.9.9.23+dfsg1-3	1,476.0 kB	1,701.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.7 kB	1,877.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,474.5 kB	5,722.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,476.4 kB	1,705.0 kB	[lista de arquivos]