Paketti: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3 ja muut)

[ Source: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Muut pakettiin sprai liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• dep: time

  GNU time ohjelma suorittimen resurssien käytön seurantaan

• sug: make

  utility for directing compilation

• sug: pbalign

  Paketti ei saatavilla

• sug: pbgenomicconsensus

  Paketti ei saatavilla

• sug: pbh5tools

  Paketti ei saatavilla

Imuroi sprai

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,476.5 kt	1,881.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.2 kt	1,713.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.9.9.23+dfsg1-3	1,473.8 kt	1,881.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.9.9.23+dfsg1-3	1,473.0 kt	1,693.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.9.9.23+dfsg1-3	1,471.6 kt	1,669.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,475.5 kt	1,692.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.6 kt	1,713.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	0.9.9.23+dfsg1-2	1,485.0 kt	1,738.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,475.8 kt	1,721.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,474.6 kt	1,693.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.2 kt	1,885.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.7 kt	1,881.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1,478.1 kt	1,881.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	0.9.9.23+dfsg1-3	1,474.3 kt	1,689.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.9.9.23+dfsg1-3	1,476.0 kt	1,701.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.7 kt	1,877.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,474.5 kt	5,722.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,476.4 kt	1,705.0 kt	[tiedostoluettelo]