Balík: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3 a iné)

[ Zdroj: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom sprai

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: time

  program GNU time na meranie využitia zdrojov CPU

• sug: make

  nástroj na riadenie kompilácie

• sug: pbalign

  Balík nie je dostupný

• sug: pbgenomicconsensus

  Balík nie je dostupný

• sug: pbh5tools

  Balík nie je dostupný

Stiahnuť sprai

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,476.5 kB	1,881.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.2 kB	1,713.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.9.9.23+dfsg1-3	1,473.8 kB	1,881.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.9.9.23+dfsg1-3	1,473.0 kB	1,693.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.9.9.23+dfsg1-3	1,471.6 kB	1,669.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,475.5 kB	1,692.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.6 kB	1,713.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	0.9.9.23+dfsg1-2	1,485.0 kB	1,738.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,475.8 kB	1,721.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,474.6 kB	1,693.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.2 kB	1,885.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.7 kB	1,881.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1,478.1 kB	1,881.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	0.9.9.23+dfsg1-3	1,474.3 kB	1,689.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	0.9.9.23+dfsg1-3	1,476.0 kB	1,701.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,477.7 kB	1,877.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,474.5 kB	5,722.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	0.9.9.23+dfsg1-3	1,476.4 kB	1,705.0 kB	[zoznam súborov]