Пакет: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3 и други)

[ Източник: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Други пакети, свързани с sprai

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• dep: time

  GNU time program for measuring CPU resource usage

• sug: make

  utility for directing compilation

• sug: pbalign

  Пакетът не е наличен

• sug: pbgenomicconsensus

  Пакетът не е наличен

• sug: pbh5tools

  Пакетът не е наличен

Изтегляне на sprai

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 476,5 кБ	1 881,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,2 кБ	1 713,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	0.9.9.23+dfsg1-3	1 473,8 кБ	1 881,0 кБ	[списък на файловете]
armel	0.9.9.23+dfsg1-3	1 473,0 кБ	1 693,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	0.9.9.23+dfsg1-3	1 471,6 кБ	1 669,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 475,5 кБ	1 692,0 кБ	[списък на файловете]
i386	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,6 кБ	1 713,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 485,0 кБ	1 738,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 475,8 кБ	1 721,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 474,6 кБ	1 693,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,2 кБ	1 885,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,7 кБ	1 881,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1 478,1 кБ	1 881,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	0.9.9.23+dfsg1-3	1 474,3 кБ	1 689,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	0.9.9.23+dfsg1-3	1 476,0 кБ	1 701,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,7 кБ	1 877,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 474,5 кБ	5 722,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 476,4 кБ	1 705,0 кБ	[списък на файловете]