Pakiet: ncbi-blast+ (2.12.0+ds-4 i inne)

[ Pakiet źródłowy: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: use::analysing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z ncbi-blast+

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Biblioteka współdzielona LMDB (Lightning Memory-Mapped Database)

• dep: libmbedcrypto7t64 (>= 2.28.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls14t64 (>= 2.28.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedx509-1t64 (>= 2.28.0) [sparc64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: ncbi-data

  Platform-independent data for the NCBI toolkit

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie ncbi-blast+

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	11 414,4 KiB	59 755,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.12.0+ds-4+b1	12 226,1 KiB	52 824,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.12.0+ds-4+b1	11 321,3 KiB	56 237,0 KiB	[lista plików]
armel	2.12.0+ds-4+b1	10 416,5 KiB	44 383,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.12.0+ds-4+b1	10 664,3 KiB	36 159,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	12 196,1 KiB	55 431,0 KiB	[lista plików]
i386	2.12.0+ds-4+b1	13 067,7 KiB	51 440,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	13 417,0 KiB	85 192,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	11 678,1 KiB	48 393,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.12.0+ds-4+b1	8 912,6 KiB	61 322,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	12 120,1 KiB	68 076,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.12.0+ds-4+b1	12 133,2 KiB	63 275,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.12.0+ds-4+b2	11 810,1 KiB	43 898,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.12.0+ds-4+b1	11 697,8 KiB	52 282,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	13 662,6 KiB	51 600,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	10 724,6 KiB	141 421,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	12 208,2 KiB	47 947,0 KiB	[lista plików]