Pakiet: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-6 i inne)

[ Pakiet źródłowy: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: use::analysing, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z ncbi-blast+

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, m68k, sh4]

  Biblioteka wsparcia zapewniająca wbudowane funkcje __atomic

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, x32]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Biblioteka współdzielona LMDB (Lightning Memory-Mapped Database)

• dep: libmbedcrypto16 (>= 3.6.0) [nie alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedcrypto7t64 (>= 2.28.0) [alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls14t64 (>= 2.28.0) [alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedtls21 (>= 3.6.0) [nie alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedx509-7 (>= 3.6.0) [nie alpha, ia64]

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0) [nie alpha, ia64]

  Biblioteka implementująca protokół HTTP/2 (biblioteka współdzielona)

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22) [nie alpha, ia64]

  Nowa biblioteka wyrażeń regularnych zgodna z Perl - 8-bitowe pliki uruchomieniowe

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12) [nie alpha, ia64]

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha, ia64, m68k]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nie alpha, ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: libuv1 (>= 1.33.1) [ppc64, sparc64, x32]

  asynchronous event notification library - runtime library

• dep: libuv1t64 (>= 1.33.1) [nie alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32]

  asynchronous event notification library - runtime library

• dep: ncbi-data

  Platform-independent data for the NCBI toolkit

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• enh: t-coffee

  Wielosekwencyjne wyrównanie

Pobieranie ncbi-blast+

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	11 414,4 KiB	59 755,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.16.0+ds-6+b1	14 885,0 KiB	66 761,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.16.0+ds-6+b1	13 516,8 KiB	69 382,0 KiB	[lista plików]
armel	2.16.0+ds-6+b1	12 804,2 KiB	57 042,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.16.0+ds-6+b1	13 063,5 KiB	46 863,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-6+b1	14 763,6 KiB	70 272,0 KiB	[lista plików]
i386	2.16.0+ds-6+b1	16 211,9 KiB	68 311,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.12.0+ds-4+b1	13 417,0 KiB	85 192,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-6+b1	14 155,7 KiB	61 829,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.16.0+ds-6+b1	11 177,5 KiB	86 558,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-6+b1	14 677,8 KiB	86 214,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.16.0+ds-6+b1	14 624,6 KiB	79 174,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.16.0+ds-6+b1	14 360,2 KiB	56 113,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.16.0+ds-6+b1	14 165,3 KiB	66 145,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-6+b1	25 738,4 KiB	176 611,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-6+b1	12 238,6 KiB	149 916,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.16.0+ds-6+b1	14 955,6 KiB	60 947,0 KiB	[lista plików]