Пакет: sprai (0.9.9.23+dfsg1-3 и другие)

[ Источник: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Другие пакеты, относящиеся к sprai

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.30) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

• dep: ncbi-blast+

  поиск первичных биологических последовательностей

• dep: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

• dep: time

  GNU time — программа для измерения использования ресурсов

• sug: make

  утилита управления компиляцией

• sug: pbalign

  Пакет недоступен

• sug: pbgenomicconsensus

  Пакет недоступен

• sug: pbh5tools

  Пакет недоступен

Загрузка sprai

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 476,5 Кб	1 881,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,2 Кб	1 713,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.9.9.23+dfsg1-3	1 473,8 Кб	1 881,0 Кб	[список файлов]
armel	0.9.9.23+dfsg1-3	1 473,0 Кб	1 693,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.9.9.23+dfsg1-3	1 471,6 Кб	1 669,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 475,5 Кб	1 692,0 Кб	[список файлов]
i386	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,6 Кб	1 713,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.9.9.23+dfsg1-2	1 485,0 Кб	1 738,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 475,8 Кб	1 721,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 474,6 Кб	1 693,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,2 Кб	1 885,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,7 Кб	1 881,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.9.9.23+dfsg1-3	1 478,1 Кб	1 881,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.9.9.23+dfsg1-3	1 474,3 Кб	1 689,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.9.9.23+dfsg1-3	1 476,0 Кб	1 701,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 477,7 Кб	1 877,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 474,5 Кб	5 722,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.9.9.23+dfsg1-3	1 476,4 Кб	1 705,0 Кб	[список файлов]