Pakiet: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 i inne)

[ Pakiet źródłowy: daligner  ]

Odkrywanie lokalnego dopasowania między odczytami długich sekwencji nukleotydowych

Narzędzia te umożliwiają znalezienie wszystkich istotnych lokalnych wyrównań między odczytami zakodowanymi w bazie danych Dazzler. Zakłada się, że odczyty pochodzą z sekwencera o długim czasie odczytu Pacific Biosciences RS II. Oznacza to, że odczyty są długie i zawierają dużo szumu, średnio do 15%.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: Program

Inne pakiety związane z daligner

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Pobieranie daligner

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.0+git20240119.335105d-3	213,8 KiB	1 994,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236,0 KiB	1 626,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208,1 KiB	1 931,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198,3 KiB	1 520,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198,1 KiB	1 128,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.0+git20240119.335105d-3	213,7 KiB	1 554,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227,6 KiB	1 756,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.0+git20240119.335105d-2	252,4 KiB	2 877,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.0+git20240119.335105d-3	211,8 KiB	1 560,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.0+git20240119.335105d-3	201,1 KiB	1 472,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195,5 KiB	2 039,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.0+git20240119.335105d-3	219,7 KiB	2 250,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231,4 KiB	2 186,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226,8 KiB	1 238,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240,3 KiB	1 788,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.0+git20240119.335105d-3	228,8 KiB	1 664,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.0+git20240119.335105d-3	188,4 KiB	10 454,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.0+git20240119.335105d-3	234,2 KiB	1 556,0 KiB	[lista plików]