Pacote: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 e outros)

[ Fonte: daligner  ]

descoberta de alinhamento local entre longas leituras de sequenciamento de nucleotídeos

Estas ferramentas permitem que se encontre todos os alinhamentos locais significativos entre leituras codificadas numa base de dados Dazzler. A premissa é que as leituras vêm de um sequenciador de leituras longas Pacific Biosciences RS II. Isto é, as leituras são longas e cheias de ruído, em média até 15%.

Etiquetas: Implementado em: C, Interface de usuário(a): Linha de comando, Função: Programa

Outros pacotes relacionados a daligner

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [não alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

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Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.0+git20240119.335105d-3	213.8 kB	1,994.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236.0 kB	1,626.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208.1 kB	1,931.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198.3 kB	1,520.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198.1 kB	1,128.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.0+git20240119.335105d-3	213.7 kB	1,554.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227.6 kB	1,756.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.0+git20240119.335105d-2	252.4 kB	2,877.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.0+git20240119.335105d-3	211.8 kB	1,560.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.0+git20240119.335105d-3	201.1 kB	1,472.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195.5 kB	2,039.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.0+git20240119.335105d-3	219.7 kB	2,250.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231.4 kB	2,186.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226.8 kB	1,238.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240.3 kB	1,788.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.0+git20240119.335105d-3	228.8 kB	1,664.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.0+git20240119.335105d-3	188.4 kB	10,454.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.0+git20240119.335105d-3	234.2 kB	1,556.0 kB	[lista de arquivos]