Пакет: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 и други)

[ Източник: daligner  ]

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Етикети: Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Други пакети, свързани с daligner

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Изтегляне на daligner

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.0+git20240119.335105d-3	213,8 кБ	1 994,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236,0 кБ	1 626,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208,1 кБ	1 931,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198,3 кБ	1 520,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198,1 кБ	1 128,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.0+git20240119.335105d-3	213,7 кБ	1 554,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227,6 кБ	1 756,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.0+git20240119.335105d-2	252,4 кБ	2 877,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	1.0+git20240119.335105d-3	211,8 кБ	1 560,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.0+git20240119.335105d-3	201,1 кБ	1 472,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195,5 кБ	2 039,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.0+git20240119.335105d-3	219,7 кБ	2 250,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231,4 кБ	2 186,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226,8 кБ	1 238,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240,3 кБ	1 788,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.0+git20240119.335105d-3	228,8 кБ	1 664,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.0+git20240119.335105d-3	188,4 кБ	10 454,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.0+git20240119.335105d-3	234,2 кБ	1 556,0 кБ	[списък на файловете]