Paketti: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 ja muut)

[ Source: daligner  ]

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Tagit: Implemented in: C, User Interface: Command Line, Role: Program

Muut pakettiin daligner liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Imuroi daligner

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.0+git20240119.335105d-3	213.8 kt	1,994.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236.0 kt	1,626.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208.1 kt	1,931.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198.3 kt	1,520.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198.1 kt	1,128.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.0+git20240119.335105d-3	213.7 kt	1,554.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227.6 kt	1,756.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.0+git20240119.335105d-2	252.4 kt	2,877.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	1.0+git20240119.335105d-3	211.8 kt	1,560.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.0+git20240119.335105d-3	201.1 kt	1,472.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195.5 kt	2,039.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.0+git20240119.335105d-3	219.7 kt	2,250.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231.4 kt	2,186.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226.8 kt	1,238.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240.3 kt	1,788.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.0+git20240119.335105d-3	228.8 kt	1,664.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.0+git20240119.335105d-3	188.4 kt	10,454.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.0+git20240119.335105d-3	234.2 kt	1,556.0 kt	[tiedostoluettelo]