Pakiet: dascrubber (1.1-4 i inne)

[ Pakiet źródłowy: dascrubber  ]

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Inne pakiety związane z dascrubber

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nie alpha, arm64, ia64, loong64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• sug: daligner

  Odkrywanie lokalnego dopasowania między odczytami długich sekwencji nukleotydowych

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Pobieranie dascrubber

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.1-4	159,8 KiB	1 381,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.1-4	163,9 KiB	1 185,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.1-4+b1	155,0 KiB	1 534,0 KiB	[lista plików]
armel	1.1-4	139,8 KiB	1 139,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.1-4	137,6 KiB	803,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.1-4	150,4 KiB	1 169,0 KiB	[lista plików]
i386	1.1-4	157,6 KiB	1 327,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.1-4	185,4 KiB	2 282,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.1-4	144,8 KiB	1 133,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.1-4	141,1 KiB	1 139,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.1-4	135,7 KiB	1 217,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.1-4	154,2 KiB	1 725,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.1-4	165,7 KiB	1 789,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.1-4+b1	166,3 KiB	930,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.1-4	155,1 KiB	1 237,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.1-4	159,6 KiB	999,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.1-4	130,1 KiB	1 159,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.1-4	158,9 KiB	1 151,0 KiB	[lista plików]