Pakiet: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 i inne)

[ Pakiet źródłowy: daligner  ]

Odkrywanie lokalnego dopasowania między odczytami długich sekwencji nukleotydowych

Narzędzia te umożliwiają znalezienie wszystkich istotnych lokalnych wyrównań między odczytami zakodowanymi w bazie danych Dazzler. Zakłada się, że odczyty pochodzą z sekwencera o długim czasie odczytu Pacific Biosciences RS II. Oznacza to, że odczyty są długie i zawierają dużo szumu, średnio do 15%.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: Program

Inne pakiety związane z daligner

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

Pobieranie daligner

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236,0 KiB	1 626,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208,1 KiB	1 931,0 KiB	[lista plików]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198,3 KiB	1 520,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198,1 KiB	1 128,0 KiB	[lista plików]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227,6 KiB	1 756,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195,5 KiB	2 039,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231,4 KiB	2 186,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226,8 KiB	1 238,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240,3 KiB	1 788,0 KiB	[lista plików]