Paket: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 und andere)

[ Quellcode: daligner  ]

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Markierungen: Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu daligner

• dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

daligner herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.0+git20240119.335105d-3	213,8 kB	1.994,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236,0 kB	1.626,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208,1 kB	1.931,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198,3 kB	1.520,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198,1 kB	1.128,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.0+git20240119.335105d-3	213,7 kB	1.554,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227,6 kB	1.756,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.0+git20240119.335105d-2	252,4 kB	2.877,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	1.0+git20240119.335105d-3	211,8 kB	1.560,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.0+git20240119.335105d-3	201,1 kB	1.472,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195,5 kB	2.039,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.0+git20240119.335105d-3	219,7 kB	2.250,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231,4 kB	2.186,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226,8 kB	1.238,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240,3 kB	1.788,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.0+git20240119.335105d-3	228,8 kB	1.664,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.0+git20240119.335105d-3	188,4 kB	10.454,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.0+git20240119.335105d-3	234,2 kB	1.556,0 kB	[Liste der Dateien]