パッケージ: lagan (2.0-6)

[ ソース: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

その他の lagan 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

lagan のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	174.9 kB	820.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	169.4 kB	736.0 kB	[ファイル一覧]
armel	159.7 kB	665.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	160.2 kB	565.0 kB	[ファイル一覧]
i386	183.8 kB	821.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	179.1 kB	832.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	181.0 kB	761.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	196.7 kB	1,888.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	170.7 kB	784.0 kB	[ファイル一覧]