パッケージ: garli-mpi (2.1-9)

[ ソース: garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

その他の garli-mpi 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.38) [arm64 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, riscv64 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libmpich12 [armel, armhf, i386]

  Shared libraries for MPICH

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [amd64 以外]

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [armel, armhf, i386 以外]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: mpi-default-bin

  Standard MPI runtime programs (metapackage)

garli-mpi のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	622.2 kB	1,656.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	560.1 kB	1,428.0 kB	[ファイル一覧]
armel	537.3 kB	1,427.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	505.2 kB	979.0 kB	[ファイル一覧]
i386	556.0 kB	1,571.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	609.3 kB	1,838.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	687.3 kB	1,748.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	657.0 kB	1,272.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	509.1 kB	1,572.0 kB	[ファイル一覧]