パッケージ: garli-mpi (2.1-7)

[ ソース: garli  ]

phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)

GARLI, Genetic Algorithm for Rapid Likelihood Inference is a program for inferring phylogenetic trees. Using an approach similar to a classical genetic algorithm, it rapidly searches the space of evolutionary trees and model parameters to find the solution maximizing the likelihood score. It implements nucleotide, amino acid and codon-based models of sequence evolution, and runs on all platforms. The latest version adds support for partitioned models and morphology-like datatypes.

This version of Garli is using MPI.

その他の garli-mpi 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libncl2 (>= 2.1.18) [amd64]

  NEXUS Class Library

  dep: libncl2 (>= 2.1.21+git20210811.b1213a7) [amd64 以外]

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

garli-mpi のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	601.8 kB	1,640.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	551.6 kB	1,432.0 kB	[ファイル一覧]
armel	493.7 kB	1,319.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	472.4 kB	919.0 kB	[ファイル一覧]
i386	534.4 kB	1,535.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	590.4 kB	1,833.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	587.2 kB	1,743.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	669.9 kB	1,812.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	492.4 kB	1,572.0 kB	[ファイル一覧]