パッケージ: freebayes (1.3.9-1 など)

[ ソース: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

その他の freebayes 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, ppc64, sparc64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 14.2.0-17) [loong64]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [amd64 以外]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [alpha 以外]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-16) [alpha]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libtabixpp0t64 (>= 1.0.0) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64 以外]

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.12+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64 以外]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

freebayes のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.3.9-1	1,470.2 kB	4,306.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.3.9-1	1,487.6 kB	4,126.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.3.9-1	1,426.3 kB	4,045.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.3.6-2+b1	1,561.5 kB	5,564.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	1.3.9-1	1,462.4 kB	4,173.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.3.6-2+b1	1,396.9 kB	3,912.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.3.9-1	1,470.3 kB	4,437.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.3.6-2+b1	1,458.5 kB	4,480.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.3.9-1	1,503.2 kB	4,430.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.3.9-1	1,489.8 kB	3,774.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.3.6-2+b1	1,531.0 kB	3,898.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.3.6-2+b1	1,354.8 kB	4,621.0 kB	[ファイル一覧]