パッケージ: freebayes (1.3.6-2)

[ ソース: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

その他の freebayes 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el]

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [amd64 以外]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg)

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

freebayes のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1,441.5 kB	3,976.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1,391.0 kB	3,903.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1,377.0 kB	3,903.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1,384.4 kB	3,455.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1,502.8 kB	4,171.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1,435.5 kB	4,360.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	1,453.7 kB	4,345.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1,461.7 kB	4,288.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1,383.8 kB	4,050.0 kB	[ファイル一覧]