パッケージ: freebayes (1.3.7-1~exp など)

[ ソース: freebayes  ]

試験的な (experimental の) パッケージ

警告: このパッケージは experimental ディストリビューションのものです。つまり、おそらく不安定でバグがあり、それどころかデータの損失を起こすかもしれません。使用前には、変更履歴やその他の参照可能なドキュメントを必ず調べてください。

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

その他の freebayes 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [amd64 以外]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [armel, armhf, i386, riscv64, s390x, sparc64 以外]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64 以外]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

  dep: libvcflib1 (>= 1.0.9+dfsg) [riscv64]

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

freebayes のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.3.7-1~exp+b1	1,453.0 kB	4,027.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.3.7-1~exp+b1	1,397.1 kB	3,922.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.3.7-1~exp	1,378.4 kB	3,821.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.3.7-1~exp	1,386.2 kB	3,445.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.3.7-1~exp	1,502.3 kB	4,185.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.3.7-1~exp+b1	1,573.9 kB	5,599.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.3.7-1~exp+b1	1,404.1 kB	3,930.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.3.7-1~exp+b1	1,428.4 kB	4,378.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.3.7-1~exp+b1	1,455.3 kB	4,498.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.3.7-1~exp+b1	1,473.5 kB	4,307.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64 (非公式の移植版)	1.3.7-1~exp	1,435.6 kB	3,701.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.3.7-1~exp	1,375.9 kB	4,052.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.3.7-1~exp+b1	1,533.1 kB	3,916.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.3.7-1~exp	1,357.1 kB	4,639.0 kB	[ファイル一覧]