Paket: freebayes (1.3.7-1 und andere)

[ Quellcode: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Andere Pakete mit Bezug zu freebayes

• dep: libc6 (>= 2.34) [nicht alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [nicht amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht alpha]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-2) [alpha]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [nicht ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.3.7-1	1.451,7 kB	4.308,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.3.7-1	1.452,7 kB	4.024,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.3.7-1	1.397,0 kB	3.919,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.3.6-2+b1	1.561,5 kB	5.564,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.3.6-2+b1	1.396,9 kB	3.912,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.3.7-1	1.428,4 kB	4.375,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.3.6-2+b1	1.458,5 kB	4.480,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.3.7-1	1.473,4 kB	4.304,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.3.7-1+b1	1.459,7 kB	3.736,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.3.6-2+b1	1.531,0 kB	3.898,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.3.6-2+b1	1.354,8 kB	4.621,0 kB	[Liste der Dateien]