Paket: freebayes (1.3.7-1 och andra)

[ Källkod: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Andra paket besläktade med freebayes

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [ej amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ej alpha]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 13.2.0-2) [alpha]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.9+dfsg1) [ej ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressionsbibliotek - körtidspaket

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

Hämta freebayes

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.3.7-1	1.451,7 kbyte	4.308,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.3.7-1	1.452,7 kbyte	4.024,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.3.7-1	1.397,0 kbyte	3.919,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.3.6-2+b1	1.561,5 kbyte	5.564,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.3.6-2+b1	1.396,9 kbyte	3.912,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.3.7-1	1.428,4 kbyte	4.375,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.3.6-2+b1	1.458,5 kbyte	4.480,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.3.7-1	1.473,4 kbyte	4.304,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.3.7-1+b1	1.459,7 kbyte	3.736,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.3.6-2+b1	1.531,0 kbyte	3.898,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.3.6-2+b1	1.354,8 kbyte	4.621,0 kbyte	[filförteckning]