Pacote: freebayes (1.3.9-1 e outros)

[ Fonte: freebayes  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Outros pacotes relacionados a freebayes

• dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, ppc64, sparc64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 14.2.0-17) [loong64]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, ppc64, ppc64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, mips64el, riscv64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0) [amd64]

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

  dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg) [não amd64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [não alpha]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-16) [alpha]

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  wrapper C++ para indexador tabix

• dep: libtabixpp0t64 (>= 1.0.0) [não ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  wrapper C++ para indexador tabix

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: libvcflib2 (>= 1.0.12+dfsg) [não ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64]

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

• rec: parallel

  construir e executar linhas de comando da entrada padrão em paralelo

Download de freebayes

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.3.9-1	1,470.2 kB	4,306.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.3.9-1	1,487.6 kB	4,126.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.3.9-1	1,426.3 kB	4,045.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.3.6-2+b1	1,561.5 kB	5,564.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.3.9-1	1,462.4 kB	4,173.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.3.6-2+b1	1,396.9 kB	3,912.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.3.9-1	1,470.3 kB	4,437.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.3.6-2+b1	1,458.5 kB	4,480.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.3.9-1	1,503.2 kB	4,430.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.3.9-1	1,489.8 kB	3,774.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.3.6-2+b1	1,531.0 kB	3,898.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.3.6-2+b1	1,354.8 kB	4,621.0 kB	[lista de arquivos]