Package: mmseqs2 (15-6f452+ds-2 and others)

[ Source: mmseqs2  ]

raggruppamento in cluster e ricerca di proteine ultra-veloce e sensibile

MMseqs2 (ricerca di sequenze Many-against-Many, molti-contro-molti) è una suite software per cercare e fare cluster di enormi insiemi di sequenze proteiche/nucleotidiche. MMseqs2 è software open source con licenza GPL implementato in C++ per Linux, MacOS e (come versione beta attraverso cygwin) Windows. Il software è progettato per essere eseguito su core e server multipli e dimostra una scalabilità molto buona. L'esecuzione di MMseqs2 può essere 10.000 volte più veloce di BLAST. A 100 volte la sua velocità ottiene quasi la stessa sensibilità. Può effettuare ricerche di profili con la stessa sensibilità di PSI-BLAST a una velocità più di 400 volte superiore.

Other Packages Related to mmseqs2

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  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

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• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, loong64, ppc64, x32]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64, sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  libreria di supporto a GCC

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• dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg) [not amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  fornisce le funzionalità della libreria C zlib in un iostream C++

  dep: libgzstream0 (>= 1.5+git20171107.9a20658) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [amd64, arm64, ia64, loong64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime

• dep: libzstd1 (>= 1.3.8) [alpha, hppa, m68k, ppc64, sparc64]

  veloce algoritmo di compressione senza perdita

  dep: libzstd1 (>= 1.4.0) [sh4, x32]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  libreria di compressione - runtime

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.6) [amd64, arm64, ia64, loong64, mips64el, ppc64el, riscv64]

Download mmseqs2

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	12-113e3+ds-3+b1	4,605.9 kB	9,018.0 kB	[list of files]
amd64	15-6f452+ds-2+b3	23,674.3 kB	71,094.0 kB	[list of files]
arm64	15-6f452+ds-2+b3	6,973.3 kB	15,864.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	12-113e3+ds-2+b1	4,494.2 kB	7,857.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	15-6f452+ds-2	7,602.6 kB	23,212.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	15-6f452+ds-2+b2	7,096.7 kB	16,376.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	12-113e3+ds-2+b1	4,368.5 kB	7,775.0 kB	[list of files]
mips64el	15-6f452+ds-2+b3	6,932.1 kB	16,790.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	12-113e3+ds-2+b1	4,402.7 kB	8,061.0 kB	[list of files]
ppc64el	15-6f452+ds-2+b3	7,195.4 kB	17,208.0 kB	[list of files]
riscv64	15-6f452+ds-2+b4	7,330.3 kB	15,556.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	12-113e3+ds-3+b1	4,800.2 kB	7,324.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	11-e1a1c+ds-4	4,158.7 kB	7,066.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	12-113e3+ds-3+b1	4,529.1 kB	7,777.0 kB	[list of files]