Package: mmseqs2 (15-6f452+ds-2 and others)

[ Source: mmseqs2  ]

raggruppamento in cluster e ricerca di proteine ultra-veloce e sensibile

MMseqs2 (ricerca di sequenze Many-against-Many, molti-contro-molti) è una suite software per cercare e fare cluster di enormi insiemi di sequenze proteiche/nucleotidiche. MMseqs2 è software open source con licenza GPL implementato in C++ per Linux, MacOS e (come versione beta attraverso cygwin) Windows. Il software è progettato per essere eseguito su core e server multipli e dimostra una scalabilità molto buona. L'esecuzione di MMseqs2 può essere 10.000 volte più veloce di BLAST. A 100 volte la sua velocità ottiene quasi la stessa sensibilità. Può effettuare ricerche di profili con la stessa sensibilità di PSI-BLAST a una velocità più di 400 volte superiore.

Other Packages Related to mmseqs2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [not ppc64el]

  libreria ausiliaria che fornisce funzioni __atomic incorporate

• dep: libbz2-1.0

  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

  fornisce le funzionalità della libreria C zlib in un iostream C++

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  libreria di compressione - runtime

Download mmseqs2

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	15-6f452+ds-2+b2	23,666.1 kB	71,106.0 kB	[list of files]
arm64	15-6f452+ds-2+b2	6,966.0 kB	15,864.0 kB	[list of files]
mips64el	15-6f452+ds-2+b2	6,929.0 kB	16,789.0 kB	[list of files]
ppc64el	15-6f452+ds-2+b2	7,186.5 kB	17,208.0 kB	[list of files]
riscv64	15-6f452+ds-2+b3	7,325.7 kB	15,548.0 kB	[list of files]