Package: mmseqs2 (12-113e3+ds-3 and others)

[ Source: mmseqs2  ]

raggruppamento in cluster e ricerca di proteine ultra-veloce e sensibile

MMseqs2 (ricerca di sequenze Many-against-Many, molti-contro-molti) è una suite software per cercare e fare cluster di enormi insiemi di sequenze proteiche/nucleotidiche. MMseqs2 è software open source con licenza GPL implementato in C++ per Linux, MacOS e (come versione beta attraverso cygwin) Windows. Il software è progettato per essere eseguito su core e server multipli e dimostra una scalabilità molto buona. L'esecuzione di MMseqs2 può essere 10.000 volte più veloce di BLAST. A 100 volte la sua velocità ottiene quasi la stessa sensibilità. Può effettuare ricerche di profili con la stessa sensibilità di PSI-BLAST a una velocità più di 400 volte superiore.

Other Packages Related to mmseqs2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [not armhf, i386, ppc64el]

  libreria ausiliaria che fornisce funzioni __atomic incorporate

• dep: libbz2-1.0

  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

  fornisce le funzionalità della libreria C zlib in un iostream C++

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  libreria GNU Standard C++, versione 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]

• dep: libzstd1 (>= 1.4.0)

  veloce algoritmo di compressione senza perdita

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download mmseqs2

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	12-113e3+ds-3+b1	6,422.6 kB	27,745.0 kB	[list of files]
arm64	12-113e3+ds-3+b1	4,392.2 kB	7,557.0 kB	[list of files]
armel	12-113e3+ds-3+b1	4,368.0 kB	7,590.0 kB	[list of files]
armhf	12-113e3+ds-3+b1	4,428.5 kB	6,574.0 kB	[list of files]
i386	12-113e3+ds-3+b1	8,546.8 kB	42,009.0 kB	[list of files]
mips64el	12-113e3+ds-3+b1	4,319.5 kB	8,242.0 kB	[list of files]
mipsel	12-113e3+ds-3+b1	4,323.8 kB	8,181.0 kB	[list of files]
ppc64el	12-113e3+ds-3+b1	4,438.4 kB	7,933.0 kB	[list of files]