Pacote: mmseqs2 (15-6f452+ds-2 e outros)

[ Fonte: mmseqs2  ]

ultra fast and sensitive protein search and clustering

MMseqs2 (Many-against-Many sequence searching) is a software suite to search and cluster huge proteins/nucleotide sequence sets. MMseqs2 is open source GPL-licensed software implemented in C++ for Linux, MacOS, and (as beta version, via cygwin) Windows. The software is designed to run on multiple cores and servers and exhibits very good scalability. MMseqs2 can run 10000 times faster than BLAST. At 100 times its speed it achieves almost the same sensitivity. It can perform profile searches with the same sensitivity as PSI-BLAST at over 400 times its speed.

Outros pacotes relacionados a mmseqs2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [não ppc64, ppc64el, sparc64, x32]

  biblioteca de apoio que provê funções embutidas __atomic

• dep: libbz2-1.0

  bib. de alta qualid. de compactação de arqs. bas. em ordenação de blocos - exec

• dep: libc6 (>= 2.29) [hppa, m68k, ppc64, sparc64, x32]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, loong64, ppc64, x32]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, mips64el, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64, sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  biblioteca de suporte ao GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg) [não amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  provide functionality of zlib C-library in a C++ iostream

  dep: libgzstream0 (>= 1.5+git20171107.9a20658) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [amd64, arm64, ia64, loong64, mips64el, ppc64el, riscv64]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: libzstd1 (>= 1.3.8) [alpha, hppa, m68k, ppc64, sparc64]

  algoritmo de compressão sem perdas rápido

  dep: libzstd1 (>= 1.4.0) [sh4, x32]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  biblioteca de compressão - runtime (tempo de execução)

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.6) [amd64, arm64, ia64, loong64, mips64el, ppc64el, riscv64]

Download de mmseqs2

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	12-113e3+ds-3+b1	4,605.9 kB	9,018.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	15-6f452+ds-2+b3	23,674.3 kB	71,094.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	15-6f452+ds-2+b3	6,973.3 kB	15,864.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	12-113e3+ds-2+b1	4,494.2 kB	7,857.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	15-6f452+ds-2	7,602.6 kB	23,212.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	15-6f452+ds-2+b2	7,096.7 kB	16,376.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	12-113e3+ds-2+b1	4,368.5 kB	7,775.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	15-6f452+ds-2+b3	6,932.1 kB	16,790.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	12-113e3+ds-2+b1	4,402.7 kB	8,061.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	15-6f452+ds-2+b3	7,195.4 kB	17,208.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	15-6f452+ds-2+b4	7,330.3 kB	15,556.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	12-113e3+ds-3+b1	4,800.2 kB	7,324.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	11-e1a1c+ds-4	4,158.7 kB	7,066.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	12-113e3+ds-3+b1	4,529.1 kB	7,777.0 kB	[lista de arquivos]