Package: bedtools (2.30.0+dfsg-1)

[ Source: bedtools  ]

suite di utilità per confrontare tratti genomici

Le utilità BEDTools permettono di affrontare compiti comuni negli studi genomici, come trovare i tratti che si sovrappongono e calcolare la copertura. Le utilità sono largamente basate su quattro formati di file di largo uso: BED, GFF/GTF, VCF e SAM/BAM. Usando BEDTools si possono sviluppare pipe sofisticate che rispondono a domande di ricerca complesse mediante l'uso di svariati BEDTools in un flusso comune.

L'utilità groupBy è distribuita nel pacchetto filo.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to bedtools

• dep: libbz2-1.0

  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  libreria per compressione in formato XZ

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  libreria di compressione - runtime

Download bedtools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	647.5 kB	2,060.0 kB	[list of files]
arm64	565.4 kB	1,864.0 kB	[list of files]
armel	535.4 kB	1,759.0 kB	[list of files]
armhf	559.3 kB	1,275.0 kB	[list of files]
i386	708.4 kB	2,275.0 kB	[list of files]
mips64el	585.1 kB	2,591.0 kB	[list of files]
mipsel	603.6 kB	2,459.0 kB	[list of files]
ppc64el	663.0 kB	2,520.0 kB	[list of files]
s390x	567.1 kB	2,100.0 kB	[list of files]