Пакет: bedtools (2.30.0+dfsg-1)

[ Източник: bedtools  ]

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Други пакети, свързани с bedtools

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-format compression library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  compression library - runtime

Изтегляне на bedtools

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	647,5 кБ	2 060,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	565,4 кБ	1 864,0 кБ	[списък на файловете]
armel	535,4 кБ	1 759,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	559,3 кБ	1 275,0 кБ	[списък на файловете]
i386	708,4 кБ	2 275,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	585,1 кБ	2 591,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	603,6 кБ	2 459,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	663,0 кБ	2 520,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	567,1 кБ	2 100,0 кБ	[списък на файловете]