Package: bedtools (2.27.1+dfsg-4)

[ Source: bedtools  ]

suite di utilità per confrontare tratti genomici

Le utilità BEDTools permettono di affrontare compiti comuni negli studi genomici, come trovare i tratti che si sovrappongono e calcolare la copertura. Le utilità sono largamente basate su quattro formati di file di largo uso: BED, GFF/GTF, VCF e SAM/BAM. Usando BEDTools si possono sviluppare pipe sofisticate che rispondono a domande di ricerca complesse mediante l'uso di svariati BEDTools in un flusso comune.

L'utilità groupBy è distribuita nel pacchetto filo.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to bedtools

• dep: libc6 (>= 2.23)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [amd64]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

  dep: libgcc1 (>= 1:4.2) [arm64]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	579.5 kB	1,955.0 kB	[list of files]
arm64	515.0 kB	1,803.0 kB	[list of files]
armhf	497.1 kB	1,190.0 kB	[list of files]