Package: bedtools (2.30.0+dfsg-3)

[ Source: bedtools  ]

suite di utilità per confrontare tratti genomici

Le utilità BEDTools permettono di affrontare compiti comuni negli studi genomici, come trovare i tratti che si sovrappongono e calcolare la copertura. Le utilità sono largamente basate su quattro formati di file di largo uso: BED, GFF/GTF, VCF e SAM/BAM. Usando BEDTools si possono sviluppare pipe sofisticate che rispondono a domande di ricerca complesse mediante l'uso di svariati BEDTools in un flusso comune.

L'utilità groupBy è distribuita nel pacchetto filo.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to bedtools

• dep: libbz2-1.0

  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

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  also a virtual package provided by libc6-udeb

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• dep: libstdc++6 (>= 11)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	649.1 kB	2,045.0 kB	[list of files]
arm64	567.0 kB	1,877.0 kB	[list of files]
armel	537.4 kB	1,748.0 kB	[list of files]
armhf	554.1 kB	1,260.0 kB	[list of files]
i386	717.1 kB	2,292.0 kB	[list of files]
mips64el	582.2 kB	2,601.0 kB	[list of files]
mipsel	601.8 kB	2,488.0 kB	[list of files]
ppc64el	666.0 kB	2,517.0 kB	[list of files]
s390x	567.4 kB	2,105.0 kB	[list of files]