Pakiet: bedtools (2.30.0+dfsg-1)

[ Pakiet źródłowy: bedtools  ]

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Zestaw, Przeznaczenie: use::analysing, use::comparing, Konwersja danych, use::filtering, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z bedtools

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Biblioteka do kompresji w formacie XZ

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie bedtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	647,5 KiB	2 060,0 KiB	[lista plików]
arm64	565,4 KiB	1 864,0 KiB	[lista plików]
armel	535,4 KiB	1 759,0 KiB	[lista plików]
armhf	559,3 KiB	1 275,0 KiB	[lista plików]
i386	708,4 KiB	2 275,0 KiB	[lista plików]
mips64el	585,1 KiB	2 591,0 KiB	[lista plików]
mipsel	603,6 KiB	2 459,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	663,0 KiB	2 520,0 KiB	[lista plików]
s390x	567,1 KiB	2 100,0 KiB	[lista plików]