Package: bedtools (2.30.0+dfsg-1)

[ Source: bedtools  ]

Programpakke med redskaber for sammenligning af arvemassefunktioner

BEDTools-redskaber giver mulighed for at adressere gængse arvemasseopgaver såsom at finde funktionsoverlap og beregne dækning. Redskaberne er hovedsagelig baseret på fire meget udbredte filformater: BED, GFF/GTF, VCF og SAM/BAM. Med brug af BEDTools kan du udvikle sofistikerede datakanaler, som besvarer komplicerede forskningsspørgsmål ved at udsende flere BEDTools sammen.

Redskabet groupBy er distribueret i pakken filo.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Suite, Purpose: use::analysing, use::comparing, Data Conversion, use::filtering, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to bedtools

• dep: libbz2-1.0

  højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, mips64el, mipsel, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Kompressionsbibliotek for XZ-formatet

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download bedtools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	647.5 kB	2,060.0 kB	[list of files]
arm64	565.4 kB	1,864.0 kB	[list of files]
armel	535.4 kB	1,759.0 kB	[list of files]
armhf	559.3 kB	1,275.0 kB	[list of files]
i386	708.4 kB	2,275.0 kB	[list of files]
mips64el	585.1 kB	2,591.0 kB	[list of files]
mipsel	603.6 kB	2,459.0 kB	[list of files]
ppc64el	663.0 kB	2,520.0 kB	[list of files]
s390x	567.1 kB	2,100.0 kB	[list of files]