Paquet : lagan (2.0-9)

[ Paquet source : lagan  ]

alignement global de séquences génomiques par paire, hautement paramétrable

Lagan prend des alignements locaux générés par CHAOS comme ancres et limite la zone de recherche de l’algorithme de Needleman-Wunsch aux alentours de ces ancres.

Multi-LAGAN est une généralisation de l’algorithme d’alignement multiple par paire de séquences. M-LAGAN réalise des alignements progressifs par paire contrôlés par un arbre phylogénétique spécifié par l’utilisateur. Les alignements sont alignés avec d’autres alignements en utilisant une métrique de somme des paires.

Autres paquets associés à lagan

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	179,3 ko	835,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	170,3 ko	1 771,0 ko	[liste des fichiers]
armel	163,8 ko	1 748,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	163,2 ko	1 748,0 ko	[liste des fichiers]
i386	187,1 ko	836,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	182,8 ko	1 865,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	185,5 ko	1 844,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	200,1 ko	1 963,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	172,6 ko	795,0 ko	[liste des fichiers]