Paket: daligner (1.0+git20240119.335105d-3 und andere)

[ Quellcode: daligner  ]

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Markierungen: Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu daligner

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	1.0+git20240119.335105d-3	236,0 kB	1.626,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.0+git20240119.335105d-3+b1	208,1 kB	1.931,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.0+git20240119.335105d-3	198,3 kB	1.520,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.0+git20240119.335105d-3	198,1 kB	1.128,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.0+git20240119.335105d-3	227,6 kB	1.756,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.0+git20240119.335105d-3	195,5 kB	2.039,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.0+git20240119.335105d-3	231,4 kB	2.186,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.0+git20240119.335105d-3	226,8 kB	1.238,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.0+git20240119.335105d-3	240,3 kB	1.788,0 kB	[Liste der Dateien]