Paket: dascrubber (1.1-4 und andere)

[ Quellcode: dascrubber  ]

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Andere Pakete mit Bezug zu dascrubber

• dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [arm64, riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nicht alpha, arm64, ia64, loong64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• sug: daligner

  local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

dascrubber herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.1-4	159,8 kB	1.381,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.1-4	163,9 kB	1.185,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.1-4+b1	155,0 kB	1.534,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.1-4	139,8 kB	1.139,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.1-4	137,6 kB	803,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.1-4	150,4 kB	1.169,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.1-4	157,6 kB	1.327,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.1-4	185,4 kB	2.282,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	1.1-4	144,8 kB	1.133,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.1-4	141,1 kB	1.139,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.1-4	135,7 kB	1.217,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.1-4	154,2 kB	1.725,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.1-4	165,7 kB	1.789,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.1-4+b1	166,3 kB	930,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.1-4	155,1 kB	1.237,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.1-4	159,6 kB	999,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.1-4	130,1 kB	1.159,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.1-4	158,9 kB	1.151,0 kB	[Liste der Dateien]