Package: tiddit (3.6.1+dfsg-2)

[ Source: tiddit  ]

Strukturel variant-kald

TIDDIT er et værktøj brugt til at identificere kromosomale omlægninger ved hjælp af Mate Pair- eller Paired End-sekventeringsdata. TIDDIT identificerer intra- og inter-kromosomale translokationer, sletninger, tandem-duplikationer og inversioner ved hjælp af supplerende justeringer samt uoverensstemmende par.

TIDDIT har to analysemoduler. Sv-tilstanden, som bruges til at søge efter strukturelle varianter. Og cov-tilstand, der analyserer læsedybden af en bam-fil og opretter en dækningsrapport.

Other Packages Related to tiddit

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-joblib

  tools to provide lightweight pipelining in Python

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  Package not available

  or python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

Download tiddit

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	483.4 kB	2,559.0 kB	[list of files]
arm64	345.9 kB	2,407.0 kB	[list of files]
armel	375.0 kB	2,519.0 kB	[list of files]
armhf	392.1 kB	1,751.0 kB	[list of files]
i386	417.1 kB	2,543.0 kB	[list of files]
mips64el	326.5 kB	2,710.0 kB	[list of files]
ppc64el	366.7 kB	2,983.0 kB	[list of files]
riscv64	403.9 kB	1,743.0 kB	[list of files]