Package: tiddit (3.6.1+dfsg-1 and others)

[ Source: tiddit  ]

Strukturel variant-kald

TIDDIT er et værktøj brugt til at identificere kromosomale omlægninger ved hjælp af Mate Pair- eller Paired End-sekventeringsdata. TIDDIT identificerer intra- og inter-kromosomale translokationer, sletninger, tandem-duplikationer og inversioner ved hjælp af supplerende justeringer samt uoverensstemmende par.

TIDDIT har to analysemoduler. Sv-tilstanden, som bruges til at søge efter strukturelle varianter. Og cov-tilstand, der analyserer læsedybden af en bam-fil og opretter en dækningsrapport.

Other Packages Related to tiddit

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-joblib

  tools to provide lightweight pipelining in Python

• dep: python3-numpy

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-pysam

  Grænseflade for SAM/BAM-sekvenssammenligning og oversættelsesformatet - Python 3

Download tiddit

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3.6.1+dfsg-1+b3	483.7 kB	2,560.0 kB	[list of files]
arm64	3.6.1+dfsg-1+b4	346.0 kB	2,408.0 kB	[list of files]
armel	3.6.1+dfsg-1+b3	374.8 kB	2,232.0 kB	[list of files]
armhf	3.6.1+dfsg-1+b3	391.8 kB	1,572.0 kB	[list of files]
i386	3.6.1+dfsg-1+b3	417.0 kB	2,544.0 kB	[list of files]
mips64el	3.6.1+dfsg-1+b3	329.4 kB	2,711.0 kB	[list of files]
ppc64el	3.6.1+dfsg-1+b3	366.6 kB	2,984.0 kB	[list of files]
riscv64	3.6.1+dfsg-1+b3	403.6 kB	1,744.0 kB	[list of files]