Package: tiddit (2.12.0+dfsg-3 and others)

[ Source: tiddit  ]

Strukturel variant-kald

TIDDIT er et værktøj brugt til at identificere kromosomale omlægninger ved hjælp af Mate Pair- eller Paired End-sekventeringsdata. TIDDIT identificerer intra- og inter-kromosomale translokationer, sletninger, tandem-duplikationer og inversioner ved hjælp af supplerende justeringer samt uoverensstemmende par.

TIDDIT har to analysemoduler. Sv-tilstanden, som bruges til at søge efter strukturelle varianter. Og cov-tilstand, der analyserer læsedybden af en bam-fil og opretter en dækningsrapport.

Other Packages Related to tiddit

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [not amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, i386, mipsel]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]

• dep: python3

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.10)

  dep: python3 (>= 3.9~)

Download tiddit

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	2.12.0+dfsg-3+b1	245.1 kB	1,040.0 kB	[list of files]
arm64	2.12.0+dfsg-3+b1	206.7 kB	835.0 kB	[list of files]
armel	2.12.0+dfsg-3+b1	207.0 kB	810.0 kB	[list of files]
armhf	2.12.0+dfsg-3+b1	213.0 kB	578.0 kB	[list of files]
i386	2.12.0+dfsg-3+b1	239.5 kB	1,019.0 kB	[list of files]
mips64el	2.12.0+dfsg-3+b1	199.4 kB	928.0 kB	[list of files]
mipsel	2.12.0+dfsg-3+b1	203.4 kB	888.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.12.0+dfsg-3+b1	228.0 kB	1,168.0 kB	[list of files]
s390x	2.12.0+dfsg-3+b1	200.7 kB	951.0 kB	[list of files]