Package: python3-biopython (1.85+dfsg-4 and others)

[ Source: python-biopython  ]

Python 3-bibliotek for bioinformatik

Biopythonprojektet er et internationalt forbund for udviklere af frit tilgængelige Pythonværktøjer til molekylær biologi via computeren.

Projektet er en distribueret samlet indsats for at udvikle Python 3-biblioteker og programmer, der adresserer behovene for nuværende og fremtidig arbejde indenfor bioinformatik. Kildekoden er gjort tilgængelig under Biopython-licensen, der er ekstrem liberal og kompatibel med næsten enhver licens i verden. Projektet arbejder sammen med Open Bioinformatics Foundation, der generøst tilbyder internetplads og CVS-plads for projektet.

Other Packages Related to python3-biopython

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]

  dep: libc6 (>= 2.34) [armel, armhf, m68k]

  dep: libc6 (>= 2.4) [i386, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]

• dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: python3 [not hppa]

  Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3

  dep: python3 (<< 3.13) [alpha, ppc64]

  dep: python3 (<< 3.14) [not alpha, hppa, ppc64, sparc64, x32]

  dep: python3 (<< 3.5) [hppa]

  dep: python3 (<< 3.7) [sparc64]

  dep: python3 (<< 3.9) [x32]

  dep: python3 (>= 3.12~) [alpha, m68k, ppc64, sh4]

  dep: python3 (>= 3.13~) [not alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  dep: python3 (>= 3.4~) [hppa]

  dep: python3 (>= 3.5~) [sparc64]

  dep: python3 (>= 3.8~) [x32]

• dep: python3-numpy [not alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  Pythonbibliotek til numeriske beregninger - Python 3

  dep: python3-numpy (>= 1:1.10.0~b1) [sparc64]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1) [x32]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [alpha, m68k, ppc64, sh4]

  dep: python3-numpy (>= 1:1.8.0) [hppa]

• dep: python3-numpy-abi9 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-reportlab [hppa, sparc64, x32]

  ReportLab-bibliotek til at oprette PDF-dokumenter der bruger Python 3

  dep: python3-reportlab (>= 4.0.4-1~) [not hppa, sparc64, x32]

• dep: w3c-sgml-lib [not hppa, sparc64, x32]

  W3.org DTD- og katalogfiler

• rec: ncbi-blast+ [not alpha, x32]

  Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer

  rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.0-3) [x32]

  rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.1-3) [alpha]

• rec: python-biopython-doc (= 1.65+dfsg-1) [hppa]

  Dokumentation for biblioteket Biopython

  rec: python-biopython-doc (= 1.70+dfsg-2) [sparc64]

  rec: python-biopython-doc (= 1.78+dfsg-2) [x32]

  rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-4) [alpha]

  rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-5) [ppc64]

  rec: python-biopython-doc (= 1.84+dfsg-4) [m68k, sh4]

  rec: python-biopython-doc (= 1.85+dfsg-4) [not alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

• sug: bwa [not hppa, sparc64]

  Burrows-Wheeler Aligner (sekvenssammenligner)

• sug: clustalo

  Alment sekvenssammenligningsprogram for proteiner

• sug: clustalw

  Global nukleotid eller peptid sekvensjustering

• sug: dialign

  Segmentbaseret flersekvensjustering

• sug: dssp

  Sekundære proteinstruktur-opgave baseret på 3D-struktur

• sug: emboss

  Programpakke til europæisk molekylærbiologi

• sug: fasttree

  Fylogenetiske træer fra opstillinger af nukleotid- eller proteinsekvenser

• sug: mafft

  Program til justering af flere aminosyrer eller nukleotide sekvenser

• sug: muscle [hppa, sparc64, x32]

  Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser

• sug: muscle3 [not hppa, sparc64, x32]

  Flerjusteringsprogram for proteinsekvenser

• sug: phylip [not hppa]

  Programpakke for udledning af fylogenier

• sug: phyml

  Fylogenisk estimering der bruger maksimum lIkelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  Flersekvens-sammenstilling baseret på probabilistisk konsistens (PROBabilistic CONSistency)

• sug: python-mysqldb [hppa, sparc64]

  Package not available

• sug: python-reportlab [hppa, sparc64]

  Package not available

• sug: python3-igraph [not alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  High performance graph data structures and algorithms (Python 3)

• sug: python3-matplotlib

  Pythonbaseret plotsystem i en stil der ligner Matlab

• sug: python3-mmtf [not hppa, sparc64]

  Binær kodning af biologiske strukturer - Python 3

• sug: python3-mysqldb [not hppa, sparc64]

  Pythongrænseflade for MySQL

• sug: python3-pil

  Python Imaging Library - Python3

• sug: python3-psycopg2

  Python 3-modul for PostgreSQL

• sug: python3-rdflib [not hppa]

  Python 3-bibliotek indeholdene et RDF triple-lager og RDF-fortolkere/serialiseringsprogrammer

  sug: python3-rdflib (>= 4) [hppa]

• sug: python3-renderpm [hppa, sparc64, x32]

  virtual package provided by python3-reportlab

• sug: python3-scipy [not hppa]

  Videnskabelige værktøjer for Python 3

• sug: python3-tk

  Tkinter - skrivning af Tk-programmer med Python 3.x

• sug: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood for pylogenetiske træer

• sug: samtools

  Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

• sug: t-coffee

  Flersekvensjustering

• sug: w3-dtd-mathml [x32]

  Package not available

• sug: wise [not hppa, sparc64]

  Sammenligning af bioplymerer, såsom DNA- og protein-sekvenser

  sug: wise (>= 2.4.1-16) [hppa, sparc64]

Download python3-biopython

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.83+dfsg1-4	1,562.6 kB	11,838.0 kB	[list of files]
amd64	1.85+dfsg-4	1,633.1 kB	11,832.0 kB	[list of files]
arm64	1.85+dfsg-4	1,618.4 kB	12,291.0 kB	[list of files]
armel	1.85+dfsg-4	1,622.1 kB	12,340.0 kB	[list of files]
armhf	1.85+dfsg-4	1,606.0 kB	12,148.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.65+dfsg-1	1,119.5 kB	7,788.0 kB	[list of files]
i386	1.85+dfsg-4	1,628.8 kB	11,817.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	1.85+dfsg-4	1,629.0 kB	12,289.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.84+dfsg-4	1,586.6 kB	11,926.0 kB	[list of files]
mips64el	1.85+dfsg-4	1,618.9 kB	12,303.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.83+dfsg1-5	1,582.7 kB	11,837.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.85+dfsg-4	1,650.5 kB	12,355.0 kB	[list of files]
riscv64	1.85+dfsg-4	1,631.2 kB	11,705.0 kB	[list of files]
s390x	1.85+dfsg-4	1,651.5 kB	11,829.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.84+dfsg-4+b1	1,623.4 kB	13,017.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.70+dfsg-2	1,139.3 kB	8,250.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.78+dfsg-2	1,365.8 kB	9,193.0 kB	[list of files]