Package: clustalw (2.1+lgpl-7 and others)

[ Source: clustalw  ]

Global nukleotid eller peptid sekvensjustering

Dette program udfører en sammenligning af flere nukleotid- eller aminosyresekvenser. Det genkender formatet for inddatasekvenser, og om sekvenser er nukleinsyre (DNA / RNA) eller aminosyre (proteiner). Uddataformatet kan vælges i forskellige formater for flere sammenligninger såsom Phylip eller FASTA. Clustal W er velaccepteret.

Produktionen af ​​Clustal W kan redigeres manuelt, men helst med et justeringssredigeringsprogram som SeaView eller indenfor dens følgesvend Clustal X. Når man bygger en model fra din sammenligning, kan denne anvendes til forbedrede databasesøgninger. Debianpakken HMMER skaber en sådan i form af en HMM.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, User Interface: Text-based Interactive, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Comparing, Supports Format: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Other Packages Related to clustalw

• dep: libc6 (>= 2.29) [not alpha, arm64, ia64, loong64, riscv64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.36) [loong64]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 11) [loong64]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [not arm64, loong64, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• sug: clustalx

  Flere sammenligninger af nukledie syre- og proteinsekvenser - grafisk brugerflade

• sug: seaview

  Grænseflade til flere platforme for sekvenssammenligning og fylogeni

• enh: bioperl-run

  BioPerl-omslag: skripter

• enh: emboss

  Programpakke til europæisk molekylærbiologi

• enh: t-coffee

  Flersekvensjustering

Download clustalw

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.1+lgpl-7	276.6 kB	920.0 kB	[list of files]
amd64	2.1+lgpl-7	275.1 kB	787.0 kB	[list of files]
arm64	2.1+lgpl-7+b1	248.9 kB	786.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.1+lgpl-7	259.6 kB	737.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.1+lgpl-7	344.9 kB	1,516.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	2.1+lgpl-7	249.1 kB	739.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.1+lgpl-7	264.7 kB	790.0 kB	[list of files]
mips64el	2.1+lgpl-7	259.1 kB	941.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.1+lgpl-7	276.1 kB	982.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.1+lgpl-7	276.5 kB	918.0 kB	[list of files]
riscv64	2.1+lgpl-7+b1	274.2 kB	622.0 kB	[list of files]
s390x	2.1+lgpl-7	247.5 kB	794.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.1+lgpl-7	314.8 kB	714.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.1+lgpl-7	231.2 kB	747.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.1+lgpl-7	275.3 kB	750.0 kB	[list of files]