Package: probcons (1.12-14 and others)

[ Source: probcons  ]

flersekvens-sammenstilling baseret på probabilistisk konsistens (PROBabilistic CONSistency)

Værktøj til at fremstille flere sammenstillinger af proteinsekvenser. Med brug af probabilistiske modelleringer og teknikker til konsistensbaserede sammenstillinger, har PROBCONS opnået den højeste nøjagtighed blandt alle sammenstillingsmetoder til dato. I BAliBASE-databasen med sammenligninger af sammenstillinger, viser sammenstillinger fremstillet af PROBCONS statistisk signifikante forbedringer i forhold til andre aktuelle programmer, indeholdende i gennemsnit 7% flere korrekt sammenstillede kolonner end de som stammer fra T-Coffee, 11% flere korrekt sammenstillede kolonner end dem fra CLUSTAL W, og 14% mere korrekt sammenstillede kolonner end dem fra DIALIGN.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to probcons

• dep: libc6 (>= 2.27) [not alpha, ia64, riscv64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.31) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.27) [alpha]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC støttebibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC støttebibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [riscv64]

  GNU Standard C++ bibliotek v3

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf, riscv64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliotek til at bestemme call-chain for et program - kørselstid

• sug: probcons-extra

  Ekstra programer fra pakken probcons

• enh: t-coffee

  Flersekvensjustering

Download probcons

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.12-14	142.6 kB	418.0 kB	[list of files]
amd64	1.12-14	116.4 kB	377.0 kB	[list of files]
arm64	1.12-14	109.1 kB	328.0 kB	[list of files]
armel	1.12-14	105.1 kB	347.0 kB	[list of files]
armhf	1.12-14	103.2 kB	255.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.12-14	128.9 kB	366.0 kB	[list of files]
i386	1.12-14	102.4 kB	367.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.12-14	191.0 kB	741.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.12-14	96.7 kB	367.0 kB	[list of files]
mips64el	1.12-14	129.1 kB	410.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.12-14	134.5 kB	481.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.12-14	136.2 kB	417.0 kB	[list of files]
riscv64	1.12-14+b1	131.1 kB	303.0 kB	[list of files]
s390x	1.12-14	99.7 kB	376.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.12-14	131.4 kB	312.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.12-14	117.5 kB	374.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.12-14	122.0 kB	371.0 kB	[list of files]